太陽系惑星への移住が進んだ時代。霧科コーポレーションの先行技術開発部にして教育機関のA-TECにやってきた転入生ナギサは、担任であるカイトの上司にあたる霧科の部長でもあった。その使命は多額の費用がかかるA-TECの解体だ。カイトたちが解体を回避する方法は一つ、SWNPRエンジンを完成させて部署の有用性を示すこと。一方、A-TECの予算枠を大幅に縮小させたナギサには学業との両立が課され、当面の目標は赤点回避……。そんな通常運行のA-TECを上層部の闇が覆い始めて!?
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