動物達が大好きだけれど、動物達はあまり懐いてくれない…。腕は確かだが、ちょっぴり残念な獣医師・朝井尊の元に、大学時代の先輩・神童新から「お前に診てもらいたい症例がある」という依頼が来る。尊が、神童に半ば強引に連れられていった先に待ち受けていたのは、“神獣”すなわち、神様だった。自然災害の原因＝神様達の病気！ 世界の命運は、一人の獣医師に託された！


動物が神格化した「神」が苦しみに喘ぐ時、巨大な厄災が引き起こされる。その因果を発見した内閣府特命防災局・神童新は、神獣を治療する事で災害を未然に防ぐ任に就く。だが、それは前代未聞の難事業。唯一の希望は、後輩の獣医師・朝井尊の存在だった！ 彼こそは、どんな動物も診ることのできる、世界で唯一の獣医師。そしてもう一人、謎の「神の使者」を加えた三人が、人知を超える“神獣”治療に挑む!!