数多の武芸者が”最強”を求め命を懸けた伝説の武芸仕合『海原大仕合』から２年。『海原大仕合』で天下無双と謳われた千石伊織の元に徳川幕府より、戦いへの誘いが届く。敵は幕府が”最強”を決めるため選んだ武芸者たち、その名は”幕下百剣”。伊織に付き従うのは、剣に魅せられた一ノ瀬家の娘・蘭。いずれも一騎当千の強者たちを相手に、千石伊織の新たな戦いが幕を開ける！！

無宝流VS.江戸幕府　全面戦争！！我間の宣戦布告が次なる戦いの舞台へ導く！神空奪還に江戸城へ乗り込んだ我間たち。四方に散った無宝流の兵はそれぞれ幕府の強者と相対する！動乱の幕下大仕合二回戦を生き抜き、三回戦へ進む修羅となるのは、果たして…。