数多の武芸者が”最強”を求め命を懸けた伝説の武芸仕合『海原大仕合』から２年。『海原大仕合』で天下無双と謳われた千石伊織の元に徳川幕府より、戦いへの誘いが届く。敵は幕府が”最強”を決めるため選んだ武芸者たち、その名は”幕下百剣”。伊織に付き従うのは、剣に魅せられた一ノ瀬家の娘・蘭。いずれも一騎当千の強者たちを相手に、千石伊織の新たな戦いが幕を開ける！！

将軍となった徳川完月は無宝流と大亀流…それに駿河藩の殲滅に向け、新たな特級天兵を呼び寄せた！江戸城に忍んでいた四門は土龍を救出し掴んだ情報を我間たちに届けようとするが──。修羅たちの戦いは最終局面へ！！