産まれた時太陽が出ているか出ていないかで、その後の人生が分かれる。
夜に産まれた赤ん坊は、その場で国に引き取られる。
彼らには兵役義務が課せられ
夜になると街を襲う死獣と戦う危険な仕事「夜勤」の兵士として、国に育てられるのだ。

夜生まれの十六歳、滝本一琉もその一人。日が落ち、新宿区が銀色のシェルターに覆われる頃、死獣はどこからともなく現れる。一琉たち夜勤は、八九式小銃と、高度文明期の遺物である太陽光線銃を手に、今夜も戦闘を開始する。平和で恵まれた昼生まれの街を守る為に。