飼い猫・お嬢と共に京都から函館へとやってきた錦織紺はひょんな事から純喫茶ねこで働くことに。マスターであり、カタブツの長男・兵真、ノリの良い大学生の次男・絢鐘、猫アレルギーの三男・穂荷、そして大勢の猫たち（貴族なねこ、お色気ねこ、美少女ねこ…中にはネコマタも！）と共に暮らしている。穂荷が通う中学校に卒業間近いタイミングで転校してきた関西弁の少女・ニコリ。慣れない学校に戸惑う彼女だったが、穂荷も所属する「民俗学研究部」に招き入れられ、歓迎会を「純喫茶ねこ」で開催することに！しかし、膝の上にお嬢がのった途端、ニコリが泣き出してしまい……？