生まれついての悪人面で周りから避けられ、クラスの嫌われ者な高校生・善(ぜん)治(じ)。
ある日突然、クラスごと異世界に転移させられ、気まぐれな神様から「領地経営」を命じられてしまった。戸惑う一同だったが、最高の土地を育てた領主は三つの願いを叶えてもらえるらしい！
善治の領地は、なんと最高の「Ｓ」ランク。だが゛喜んだのも束の間、人気者の坂宮に難癖をつけられ、領地を奪われてしまった！
領民ゼロの大ハズレ土地に放り出され途方に暮れる善治だったが、神から与えられた「生産スキル」が残されていた。スキルの力で人手も素材もアイテムも大量に作れることに気付いた善治は、クラスメイト達を見返すため、最高の領地を育てると決意する！