- 発売日:2025/01/30
- 出版社:羊土社
- ISBN:9784758122788
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改訂 独習Pythonバイオ情報解析
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商品説明
Pythonの定番テキストが待望の改訂!大規模データの取り扱いや図による可視化など汎用的なPythonの使い方から,シングルセル,RNA-seq解析までバイオインフォマティクスの基礎が身につきます.サンプルデータとコード見本付きで,今日から実践しながら学べます.改訂では,生成AIの活用方法やScanpyの詳細な解説を加筆し,各種ライブラリのアップデートに対応しました.
目次
【目次】
改訂にあたり
はじめに(初版)
第1章 この本の使い方と事前準備
第2章 生成AIを用いたプログラミング
第3章 Jupyter Notebookの使い方
第4章 Python速習コース
第5章 文字列処理の基本 〜ファイルの読み書き,正規表現
第6章 Biopythonを用いた塩基配列データの扱い方 〜オブジェクト指向入門
第7章 pandasはじめの一歩 〜表形式データの扱い方
第8章 RNA-Seqカウントデータの処理 〜pandas実践編
第9章 データの可視化 〜Matplotlib,Seabornを用いたグラフ作成
第10章 統計的仮説検定 〜RNA-Seqデータを用いた検定の基本からモデル選択まで
第11章 シングルセル解析(1) 〜テーブルデータの前処理
第12章 シングルセル解析(2) 〜次元削減
第13章 シングルセル解析(3) 〜クラスタリング
付録A NumPy入門
付録B Scanpyを使ったシングルセル解析
索引
執筆者一覧
改訂にあたり
はじめに(初版)
第1章 この本の使い方と事前準備
第2章 生成AIを用いたプログラミング
第3章 Jupyter Notebookの使い方
第4章 Python速習コース
第5章 文字列処理の基本 〜ファイルの読み書き,正規表現
第6章 Biopythonを用いた塩基配列データの扱い方 〜オブジェクト指向入門
第7章 pandasはじめの一歩 〜表形式データの扱い方
第8章 RNA-Seqカウントデータの処理 〜pandas実践編
第9章 データの可視化 〜Matplotlib,Seabornを用いたグラフ作成
第10章 統計的仮説検定 〜RNA-Seqデータを用いた検定の基本からモデル選択まで
第11章 シングルセル解析(1) 〜テーブルデータの前処理
第12章 シングルセル解析(2) 〜次元削減
第13章 シングルセル解析(3) 〜クラスタリング
付録A NumPy入門
付録B Scanpyを使ったシングルセル解析
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