大規模データで困ったときに、まず図を描くことからはじめる生命科学データ解析

【目次】
はじめに
本書の使い方
プログラミングの基本事項

第Ⅰ部　生命科学データ別にファーストアクションを学ぶ
第1章 ゲノム
第2章 トランスクリプトーム
第3章 メタゲノム/16S rRNA アンプリコンシークエンスデータ
第4章 ChIP（クロマチン免疫沈降）-seq
第5章 Hi-Cデータ
第6章 シングルセルトランスクリプトーム　〜公開データとの統合・比較解析
第7章 プロテオーム　〜網羅的なタンパク質解析と図表作成・データ登録
第8章 顕微鏡データ　〜デジタルステイニングによる細胞核の可視化と形態解析
第9章 高速原子間力顕微鏡（AFM）データ

第Ⅱ部　LLMとの対話を通じて理想のデータビジュアルをつくる
第1章 データから適切なグラフを選ぶ方法
第2章 環状ゲノムマップ　〜Circosを用いた作成方法
第3章 ヒートマップ
第4章 主成分分析（PCA）
第5章 注釈付き系統樹
第6章 ChIP（クロマチン免疫沈降）-seqピーク解析
第7章 UMAP・Trajectory解析　〜シングルセルRNA-seqデータの描画
第8章 MAプロット・Volcanoプロット　〜RStudioを使用した遺伝子発現変動を示す図の描き方

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