第1章　生物考古学とは？
人生の悩みと生物考古学／文系？　理系？／ヒトの背負う進化の時間の重み／生物考古学者の日常／生物考古学の歴史／生物考古学の特徴のまとめ／コラム1　生物考古学との出会い

第2章　形を調べる
なぜ形なのか？／ヒトかどうか／単独葬と集積葬／年齢を推定する／性別を推定する／古人口／習慣動作と骨格／歯や顎と食習慣／感染症／ストレス／科学的矛盾／損傷／コラム2　まわり道したっていいじゃない

第3章　元素を調べる
目に見えないものを調べる／安定同位体分析とは／古人骨から食生活を復元する／将軍様の御食事は？／江戸時代の離乳と人口／あるおばあさんの一生／安定同位体の測定技術の発展／コラム3　遺跡めぐりの重要性

第4章　古代DNA分析
DNAは遺伝情報を運ぶ／今をときめく古代DNA／日本列島の古代ゲノム／古代メタゲノム／古代DNAの広がる可能性　／コラム4　子供が生まれると小児骨の研究ができなくなる？

第5章　古代プロテオミクス
タンパク質は体を作る部品／古代タンパク質の研究と質量分析／遺伝情報を調べる／タンパク質独自の情報を調べる　／生物考古学における古代プロテオミクスの今後／コラム5　子供を連れてフィールドへ

第6章　生物考古学と社会
科学と社会／社会生物考古学／生物考古学研究の倫理／生物考古学は役に立つか／コラム6　生物考古学を学ぶには