第１部 制御法
＜物理的制御＞1．加熱殺菌（1-1．低温殺菌・高温殺菌・乾熱殺菌（土戸哲明）／1-2．マイクロ波加熱・高周波加熱・赤外線加熱（濱中大介）／1-3．通電加熱（五十部誠一郎））／2．紫外線殺菌（白井昭博）／3．放射線滅菌（古田雅一）4．高圧殺菌（森松和也）5．電気的殺菌（5-1．プラズマ殺菌（大澤泰樹・劉 智志・福智 魁・八井田朱音・松村有里子・伊藤典彦・岩澤篤郎・沖野晃俊）／5-2．高電圧パルス殺菌（谷野孝徳・大嶋孝之）／5-3．交流高電界殺菌（植村邦彦）／5-4．コロナ放電殺菌（瑞慶覧章朝））／6．低温保持（下島優香子）／7．除菌（7-1．洗浄（福﨑智司）／7-2．ろ過（中村一穂）／7-3．電気的除去（冨岡敏一）／8．遮断（8-1．医薬品の包装工程における遮断（砂山裕信）／8-2．清浄気流（宮地洋二郎））／9．物理的形状を利用した殺菌抗菌（9-1．規則的ナノ構造と殺菌・抗菌性（伊藤 健）／9-2．不規則なマイクロ構造と抗菌性（西谷伴子）　＜物理化学的制御＞10．水分活性（浦野博水）11．pH（内藤茂三）／12．酸化還元電位（内藤茂三）／13．酸素除去（田中宏和）　＜化学的制御＞14．消毒薬殺菌剤（14-1．塩素系（原田 裕）／14-2．酸素系（坂上吉一）／14-3．アルコール類（岩澤篤郎））／15．有機抗菌剤（15-1．有機合成系抗菌剤（坂上吉一）／15-2．天然系抗菌剤（澤井 淳（§1）／森田 洋（§2））／16．無機系抗菌剤（16-1．金属系（宮野泰征）／16-2．光触媒系（鈴木智順）／16-3．酸化カルシウム系（澤井 淳）／17．ガス殺菌剤（城之内幸宏）　＜生物学的制御＞18．発酵（乳酸菌などによる制御）（善藤威史）／19．バクテリオファージ（宮本敬久）／20．生物農薬（篠原弘亮）　＜併用制御＞21．併用処理（土戸哲明）　＜制御システム＞22．Good Manufacturing Practice（GMP）（米虫節夫）／23．HACCP・ISO など（岸本 満）／24．予測モデリング（予測微生物学）（小関成樹）／25．ハードルテクノロジー（小磯博昭）
第2部 微生物
＜細菌＞26．細菌とは（佐々木美穂）／27．感染症細菌（27-1．呼吸器系病原細菌（田丸亜貴・河原隆二・山口貴弘）／27-2．消化器系病原細菌（三好伸一））／28．食中毒細菌（28-1．感染型食中毒細菌（伊藤 智）／28-2．毒素型食中毒細菌（鎌田洋一）／28-3．生体内毒素型食中毒細菌（篠田純男）／29．腐敗変敗細菌（内藤茂三）／30．人の常在菌マイクロバイオーム（30-1．腸内フローラ（野本康二）／30-2．皮膚粘膜常在菌（濱田昌子）／30-3．口腔常在菌（中村圭祐））／31．薬剤耐性菌（31-1．メチシリン耐性黄色ブドウ球菌，バンコマイシン耐性腸球菌（石﨑直人）／31-2．β ラクタム系耐性菌・カルバペネム耐性菌（中山達哉）／31-3．薬剤耐性のメカニズムとその対策（前田拓也））／32．芽胞形成菌（32-1．好気性芽胞形成菌（高松宏治）／32-2．嫌気性芽胞形成菌（三宅眞実）／32-3．好熱性好酸性菌（後藤慶一））／33．バイオフィルム形成菌（古畑勝則）　＜真菌＞　34．真菌とは（久米田裕子）／35．病原真菌（35-1．深在性真菌症病原菌（矢口貴志）／35-2．表在性真菌症病原菌（伴 さやか）／35-3．アレルギーに関与する真菌（渡辺麻衣子））／36．食品汚染カビ（36-1．農産物の貯蔵被害を起こすカビ（千葉隆司）／36-2．市販食品のカビ被害を起こすカビ（矢内美幸・馬場 浩）／36-3．カビ毒産生カビ（小林直樹）／36-4．耐熱性カビ（枳穀 豊））／37．植物病原カビ（37-1．穀類（イネ・ムギなど）（藤 晋一）／37-2．野菜（仲川晃生）／37-3．果実（岡田清嗣・西岡輝美））／38．室内汚染カビ（38-1．空気環境中の浮遊カビ（橋本一浩）／38-2．室内環境で発生するカビ（高鳥浩介・久米田裕子）／39．木材腐朽菌（小沼ルミ）／40．酵母（内藤茂三）／41．きのこ（早乙女 梢・尾崎佑磨）　＜ウイルス＞42．ウイルスとは（嶋崎典子）／43．呼吸器系ウイルス（嶋崎典子）／44．消化器系ウイルス（吉田 弘）／45．食品媒介ウイルス（野田 衛）／46．血液媒介ウイルス（岡田義昭）／47．動物媒介ウイルス：蚊に媒介されるウイルスおよびダニに媒介されるウイルス（野島康弘）／48．性感染症（ウイルスおよび細菌）（森 裕紀子）　＜その他＞49．原虫・寄生虫類（医学領域）（阿部仁一郎）／50．ダニ・有害昆虫類（衣食住・文化財領域）（吉浪 誠・木村悟朗））
第3部 制御対象
＜食品＞51．肉（51-1．食肉（森田幸雄）／51-2．食肉製品（中島誠人））／52 魚（52-1．生鮮魚介類（山﨑浩司）／52-2．水産食品（久田 孝））／53．野菜・果実（53-1．生鮮野菜・生鮮果実（横山佳子）／53-2．カット野菜・カット果実（泉 秀実）／53-3．野菜・果実製品（森 哲也））／54．飲料水（54-1．用水・浄水器（小熊久美子）／54-2．清涼飲料・果実飲料・ミネラルウォーター（青山冬樹））／55．乳製品（55-1．生乳・牛乳（須藤朋子）／55-2．乳製品（チーズ・ヨーグルト）（岡田由美子））／56．卵製品（武内 章）／57．菓子（57-1．パン（口地眞智子）／57-2．和菓子・洋菓子（久米田裕子））／58．缶詰・レトルト食品（宮尾宗央）／59．醸造食品（59-1．酒類（髙橋正之）／59-2．その他発酵食品（川合祐史）／60．加工設備の保守管理（日佐和夫）　＜生活衛生＞61．化粧品（臼倉 淳）／62．家庭内衛生（62-1．洗顔・皮膚（頭髪シャンプー）（田邊弘毅）／62-2．喉（うがい液）（花田信弘）／62-3．手洗い（隈下祐一）／62-4．洗濯機（李 新一）／62-5．浴室（浜田信夫）　＜医療＞63．手洗い（63-1．衛生学的手洗い（山本恭子）／63-2．手術時手洗い（靍 知光））／64．医薬品（坂上吉一）／65．医療機器等（65-1．内視鏡（佐藤絹子）／65-2．手術用機器・埋め込み機器（宮本比呂志）／66．人工透析液（大薗英一）／67．手術創感染対策（橋詰直樹・靍 知光）／68．歯科領（犬伏順也・江口 徹）／69．眼科領域（井上幸次）／70．医療廃棄物（坂上吉一）　＜建築産業環境＞71．空気と空調（杉山順一）／72．生活環境水（72-1．温泉水（縣 邦雄）／72-2．プール水（枝川亜希子）／72-3．修景水（関口和弘）／72-4．冷却塔水（井上浩章）／72-5．廃水・排水（貝森繁基））／73．一般建築物・ビルディング（柳 宇）／74．博物館・美術館（川上裕司）／75．文化財・遺跡（河﨑衣美）／76．宇宙居住環境（一條知昭）／77．養殖場，養鶏場・養豚場・と畜場など（77-1．養殖場（奥西将之）／77-2．畜産農場（向本雅郁））／78．海洋（赤潮対策）（前田広人）　＜動物・ペット＞79．愛玩動物（玉原智史・川原井晋平）／80．実験動物（塚本篤士）　＜日用品・産業製品＞81．家庭用品（ホームケア製品）（西尾正也）／82．家電製品（洗濯機など，エアコン類は除く）（冨岡敏一）／83．紙・書籍（川上裕司）／84．繊維（勝圓 進）／85．金属材料（川上洋司）／86．陶器（西野駿佑）／87．木材（馬場庸介）／88．園芸用土壌（感染防止）（西岡輝美）／89．工業油（鴻巣正幸）／90．塗料（大村善彦）／91．実験用培地・器具（水落慎吾）
第4部 検査測定法
＜基礎＞92．微生物数測定技術（松岡英明・斉藤美佳子）／93．微生物培養技術（片倉啓雄）／94．病原微生物の同定（曽川一幸）／95．損傷菌の評価法（朝田良子・土戸哲明）96．各種微生物に対する標準試験法（96-1．微生物試験法（公的な試験検査）（梶浦 工・奥西淳二・菊野理津子）／96-2．微生物試験法（抗微生物評価法）（梶浦 工・奥西淳二・菊野理津子）／96-3．食品の微生物試験（大仲賢二）／97．抗菌製品の評価法（97-1．繊維製品の抗菌評価法（勝圓 進）／97-2．その他抗菌製品の評価法（太田知克））98．JEM1467 家庭用空気清浄機（岡上 晃）／99．バイオフィルムに対する評価（松村吉信）／100．芽胞に対する評価法（坂元 仁）／101．統計解析（藤川 浩）／　＜応用＞102．食品製造工場における微生物評価（土屋 禎）／103．化粧品の微生物評価（目片秀明）／104．水の衛生管理－水中の難培養菌，レジオネラの培養と検査（枝川亜希子）／105．医薬品医療機器の検査（105-1．医薬品の検査（竹田智子）／105-2．医療機器の検査（永井由紀））／106．環境測定における簡易迅速試験法（菊野理津子）／107．木材木造の生物劣化診断，防腐効力測定（酒井温子）／108．水道法に基づく水質検査（安齋博文）／109．排水処理設備における微生物コントロール（伊与 亨）／110．水産食品における微生物の検出法（古下 学）／111．農業環境生産物における微生物検査，コントロール（西岡輝美）／112．畜産環境における微生物検査（向本雅郁）／113．住環境身の回りの微生物評価（柳 宇）／114．抗菌剤抗菌加工製品の安全性試験・評価（鹿庭正昭）
資料 日本防菌防黴学会の歴史（坂上吉一）