はじめに―序章に代えて―／iii
　　目　　次／xv
　　謝　　辞／xix
　　凡　　例／xxi

Ⅰ　玄調研究130年の歩み―玄調研究の文献とその解説―
　玄調研究の文献とその解説／6
　　1899年以前／6　1900‒1949年／11　1950‒1999年／17　2000年以降／32
　　インターネットの情報／35

Ⅱ　紀州の春林軒における玄調の修業と動静
　1　『諸家手簡』の静嘉堂文庫本と国会図書館本の比較／46
　2　1827年5月15日の養父本間道偉宛ての書簡／47
　3　1827年閏6月12日の養父本間道偉宛ての書簡／51
　4　1827年閏6月12日の友人坂本了哲宛ての書簡／55
　5　1828年8月13日の小宮山楓軒宛ての書簡／57
　6　書簡に見る春林軒における玄調の動静／60
　7　玄調が青洲から受けた「知遇」の理由／61

Ⅲ　主著の「序」や「跋」に見られる玄調の動静と人物
　1　『瘍科秘録』／70
　　公　愷の「序」　70　多紀元堅の「序」　71 海保漁村の「序」　73
　　本間玄調の「序」　73
　2　『続瘍科秘録』／75
　　華岡青洲の書　75　多紀元堅の書　76
　3　『内科秘録』／77
　　青山延光の「序」　77　海保漁村の「内科秘録序」　78 本間玄調の「序」　79
　　森　蔚（しげる）の「跋」　80 小林定誠の「跋」　80

Ⅳ　主著に見る「活物窮理」―「術」から「学」への発展―
　1　「活物窮理」はいつ提唱されたのか／86
　2　「医惟在活物窮理」から「活物窮理」へ／89
　3　玄調に贈られた「活物窮理」の書／92
　4　門人への「活物窮理」の相承／94
　5　主著に見られる「活物窮理」／94
　　『瘍科秘録』（1837）　95　『続瘍科秘録』（1858）　96　『内科秘録』（1864）　96
　6　「活物窮理ノ術」から「活物窮理ノ学」への発展／97

Ⅴ　著述についての書誌的検討
　1　著述に関するこれまでの研究／103
　2　史料・文献に披見される著述／113
　3　著述の刊本と現存の写本／115
　4　現存の「薬室雑識」の写本／121
　5　「薬室雑識」の成立とその系統／124
　6　『続瘍科秘録』と「薬室雑識」関連写本との関係／135
　7　『瘍科秘録』と『続瘍科秘録』に披見される疾患／137
　8　『瘍科秘録』と『続瘍科秘録』の刊行年10年の懸隔／140
　9　著述の分類と青洲の著述との比定／141
 10　玄調の著述執筆の動機と構想／142
 11　玄調の医学の思想的背景／144

Ⅵ　『医方纂要』などの処方集の編纂
　1　『医方纂要』／149
　2　『増訂療治知要』／151
　3　『自準亭治法約言』／155
　4　『自準亭経験方匱』／157
　5　『自準亭経験方匱附録』／158
　6　『本間氏製薬方』（外題は『自準亭製薬方譜』）／159
　7　玄調の処方集と青洲の処方集／161

Ⅶ　著述の附図成立に関する考察
　1　附図についてのこれまでの研究／165
　2　刊行された著述に見られる附図／166
　　『瘍科秘録』（1837年序，1847年刊）　166
　　『続瘍科秘録』（1858年序，1859年刊）　169
　　『内科秘録』（1861年序，1867年刊）　172
　　『乳嵒新割図識』（1849年序，1849年刊）　174
　　『膀胱結石図』（序欠，1858年刊）　175
　3　写本に見られる附図／177
　　『戊申薬室雑識四編』（1848年）　177
　　『庚戌薬室雑識七編』（1850）　179
　　『辛亥薬室雑識巻之八』（1851）　179
　　『薬室雑識巻之四』（大塚本）（1858）　180
　　『薬室雑識』（巻之上，巻之下）（1856。鷹取本）　180
　　『薬室雑誌』（外題「棗軒翁薬室雑識」）（成立年不詳）　181
　　『日新医譚』（巻之一）　184
　　『日新医談』（巻之一，巻之二）　184
　　『日新医譚』（巻之三）　184
　　『日新医譚』（3巻本。巻之一―巻之三）　186
　4　刊本，写本に見られる附図と本間貞佐編『奇患図録』の関係／187
　5　玄調が描いたシーボルトの肖像画／189

Ⅷ　玄調が破門されたという虚説
　1　玄調が破門されたという風評／197
　2　玄調が「麻沸散（湯）」を公開したという風評／198
　3　玄調が秘伝を公開したという風評／201
　4　風評が誕生した背景／203

Ⅸ　本書の和文抄録と英文抄録
　A　和文抄録
　　　玄調研究130年の歩み―玄調研究の文献とその解説―／209
　　　紀州の春林軒における玄調の修業と動静／210
　　　主著の「序」や「跋」に見られる玄調の動静と人物／211
　　　主著に見る「活物窮理」―「術」から「学」への発展―／211
　　　著述についての書誌的検討／212
　　　『医方纂要』などの処方集の編纂／212
　　　著述の附図成立に関する考察／213
　　　玄調が破門されたという虚説／213
　B　English Abstracts
　　A New Study on Gencho Homma, Academic Successor to Seishu Hanaoka
　　　A 130-Year History（1892‒2021）of the Studies on Gencho Homma／214
　　　Homma’s Surgical Training at Shunrinken in 1827／216
　　　Homma’s Personality, as Revealed in the Forewords and Epilogues of
　　　　His Publications／217
　　　The Motto Katsubutsu-kyuri；from Skills to Science／217
　　　A Bibliography of Homma’s Publications and Manuscripts／218
　　　Homma’s Compilation of Ihosan-yo and Other Writings on Herbal
　　　　Prescriptions／219
　　　Figures in Homma’s Publications and Manuscripts／219
　　　A Rumor that Homma Was Expelled from Shunrinken／220

Ⅹ　著者による2005年以降の青洲関連の論文
　青洲関連の著書／226
　2005年から2023年までの青洲関連の論文／226

おわりに／233
索　　引／237