【明かされる忍者の里の真相！　託された師の想いを背負い、最強忍者は覚醒する！】
「あの日、忍者の里で何が起きたのか。」　失われた記憶を探ろうとするフォンは、仲間と共に忍者の里の跡地へ！　そこで待ち構えていたのは、密かに生き残っていた宿敵・ハンゾーだった。ハンゾーの幻術によって、フォンは仲間と共に在りし日の忍者の里の幻影を見る。そこでは、忍者が支配する世界を作るため王国転覆を目論むハンゾーと、それを止めようとする師匠が対立していた。そんな中、両者に挟まれた当時のフォンが下した決断は、すべての忍者を巻き込む悲劇を生むことに！　明かされる忍者の里滅亡の真実と師匠の願い・・・。　託された師匠の想いを胸に、宿敵・ハンゾーの野望を止めるべく最強忍者は覚醒する！