周辺国を統一して帝国を築き、覇王と呼ばれた女帝・エレオノーレは己の野望を達成した満足感の中、国の安寧を願って生涯を終えた。しかし目が覚めると、知らないベッドの上で口から血を流しており…。さらに、近くには半透明の少女・ヘルミーネが浮いていて!?　エレオノーレは暗殺されたヘルミーネの体に乗り移ってしまったこと、さらにはエレオノーレの死後三百年が経っており、自分が築き上げた帝国が内乱状態に陥ろうとしていることを知る。しかし、弱く不遇に見えたヘルミーネが実は現皇帝の弟の娘であり、末席ながらも帝位継承権を持つことを知ったエレオノーレは、自らの手で帝国を再建するためにヘルミーネと共に立ち上がる。
「この世では私の上に人が立ってはいけない。並ぶことすら許されぬ！」
ここに、のちに『厄災の聖女』と呼ばれる覇者が誕生した――。