太宰府中学校2年の東雲日夏は国語で学んだ『万葉集』2番の歌に、いるはすのないカモメが詠まれていることに疑問を持つ。「カモメ飛ぶ大和」とは何を意味するのか。歌に詠まれた「大和」とは、現在の「奈良」とは違う地域を示しているのではないのか。
従来の説に納得できなかった日夏は、かつて共に『魏志倭人伝』の謎に挑んだ阿比留翔、菊池智彦の3人で日本古代史研究会を結成。『日本書紀』を丹念に読み返しながら、この国の歴史を明らかにする【中学生3人の対話形式でつづる日本古代史】