第１章　個体を離れ集団を考える

１.１　ロードマップ

１.２　メンデルの遺伝法則

１.３　Hardy-Weinbergの法則

１.４　遺伝子プール

１.５　遺伝子プールの概念を用いて

Hardy-Weinbergの法則を導く

１.６　集団の多様性の指標：

ヘテロ接合度

１.７　ランダム交配からの逸脱．

１.８　ヘテロ接合度と近交係数の関係

１.９　まとめ


第２章　進化の力とそのバランス

２.１　ロードマップ

２.２　進化の3つの力

２.３　淘汰

２.４　遺伝的浮動

２.５　突然変異

２.６　進化の力の相互作用

２.７　中立説

２.８　まとめ


第３章　遺伝子の共有

３.１　ロードマップ

３.２　血縁関係者の間での遺伝物質の

共有率

３.３　血縁性の指標π

３.４　Ewensのサンプリング公式

３.５　量的形質と遺伝率

３.６　量的形質モデルの疾患への応用：

ライアビリティ・閾値モデル

３.７　まとめ


第４章　ハプロタイプの扱い

４.１　ロードマップ

４.２　ハプロタイプとジェノタイプ

４.３　連鎖不平衡（LD）

４.４　組換えによる連鎖不平衡の減衰

４.５　ハプロタイプブロック

４.６　非血縁集団における

ハプロタイプフェージング

４.７　ハプロタイプレベルでの

遺伝子共有の指標

４.８　まとめ


コラム：人類遺伝学と「人種」概念


第５章　コアレセント理論入門

５.１　ロードマップ

５.２　分離サイト数を求める

５.３　幾何分布

またはファーストサクセス分布

５.４　コアレセンス

５.５　田嶋のD検定

５.６　祖先組換えグラフ

５.７　まとめ


Appendix　隠れマルコフモデル

Ａ.１　隠れマルコフモデルの基本構造

Ａ.２　学習問題：

バウム・ウェルチアルゴリズム

Ａ.３　デコーディング問題：

ビタビアルゴリズム

Ａ.４　評価問題：フォワードアルゴリズム